通风系统的完善与否，直接影响实验实验人员的身体健康、实验结果的可靠性。
合理设计实验室排风
1、排风系统工程是实验室建设的关键，通风柜的效果好坏主要在于排风系统设计。
2、排风管的材料首选为FRP无机树脂材料，也可用PVC材料或PP材料风管内壁应制做粗糙面，可减少风流噪声，采用圆形或巨型均可，直径250—500mm，按照排风量要求确定尺寸。
3、FRP防腐风机种类确定：(1)轴流风机、单台通风柜，单原子吸收罩较小风量采用。(2)斜流风机、双台通风柜，双原子吸收罩，略大风量采用。(3)离心风机、多台通风柜或需要排风量较大时采用。(4)屋顶风机(同上)均可选择。
4、防腐风机应安装在室外屋顶，出风口设防雨、鸟罩，还需减振器、逆风阀、消音器、。
5、如果实验室是空调房间安装通风柜，应合理设计补风装置，以避免浪费能源。
合理设计实验室气路
1、为确保安全，实验用各种气体，有条件应远离工作点设计具有防爆性能的房间作为气体室存放，否则需设置带有全自动报警功能的气瓶安全柜存放。
2、试验产生有毒有害气体应设计负压排气系统，确保有毒有害气体不在室内泄露。
3、按照房间大小比例设计相应数量带逆风阀的换气扇，使空气流通顺畅，保持清洁。
4、每个房间都要设计带有过滤装置的通气孔，如果是带有室内走廊的房间也可在门窗上设百叶窗，尺寸按照排气量比例关系计算。